2000年签约华纳唱片公司；同年6月9日发行首张专辑《孙燕姿同名专辑》在台湾地区出道，并以专辑中的歌曲《天黑黑》成名，获得第12届金曲奖最佳新人奖；12月发行的第二张专辑《我要的幸福》入围第12届台湾金曲奖最佳女演唱人奖。

    2003年初成立个人音乐公司“Make Music”；同年8月发行第七张专辑《The Moment》，其中包括电影《向左走，向右走》的插曲《遇见》。

    2004年携专辑《Stefanie》复出乐坛，并凭此专辑在2005年获得第16届台湾金曲奖最佳国语女演唱人奖。2005年5月在”2005MTV日本音乐录像带大奖“中获得最佳大中华艺人奖。

    2006年4月凭借第九张专辑《完美的一天》获得音乐风云榜港台地区最佳女歌手、最受欢迎女歌手奖等奖项。2008年7月凭借歌曲《逆光》获得第六届中国金唱片奖音乐录影带奖；同年8月获得“2008MTV亚洲大奖”地区最受欢迎歌手奖。

    2011年发行专辑《是时候》，获得第17届新加坡金曲奖最佳专辑制作人、最受欢迎女歌手在内的六个奖项。2014年2月发行第12张专辑《克卜勒》并开展一连28场的“克卜勒”巡回演唱会，凭借该作品获得香港十大中文金曲颁奖礼全国最佳女歌手奖。

          
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    2012年5月7日，孙燕姿在结婚满一周年的前夕通过新浪微博承认自己的怀孕喜讯，并于同年10月30日晚自然分娩诞下男婴，宝宝体重约3.4公斤。

    作为一个身处聚光灯下的明星，少争议少话题、无绯闻无炒作、随性淡泊、率真洒脱的燕姿，一直以良好形象著称，这与她低调而真实的个性密切相关。她个人特点鲜明的声线、唱腔、歌曲演绎，瘦弱的身躯和强大的爆发力，和她极为独特的个性，低调生活、专心唱歌的态度，所有这些都天然地融为一体，让她成为华语乐坛一个独一无二的存在，为人称道。她的健康，她的笑容，她的声音，无不让人心动。她唱歌时，音乐是全部，她做回自己，不留多少消息。孙燕姿，坚持自我和引导流行的年代偶像，年轻一代值得学习的优质榜样。（腾讯娱乐评）